私立希望之峰学园——一所政府公认的特权学园，专门召集各个领域的超一流高中生，旨在培育他们茁壮成长。在这所学园中，不仅存在着云集了“超高校级”才能的“本科”，还设有只要支付高额学费任何人都能入读的“预备学科”。两大体制之间有着不可逾越的鸿沟，却也悄然埋下了动摇世界的种子。在“超高校级的绝望”引发的“人类史上最大最恶的绝望事件”之下，整个世界陷入了濒临崩坏的绝境。为了拯救这个充满绝望的世界，原希望之峰学园的校长与师生们集结成立了“未来机关”，其中便包括了曾打倒江之岛盾子的苗木诚等78期生。他们在此持续推进世界的复兴活动，然而苗木诚却因“庇护绝望的残党”这一罪名，遭到了众人的怀疑。当未来机关众人为了苗木诚的处分而聚集一堂时，却遭到了黑白熊的监禁，并被强制要求进行“最后的自相残杀”。他们的手臂被戴上了奇妙的手环，在一定时间过后就会被投以安眠药。不仅如此，众人之中还潜伏着为了杀光未来机关而来的“背叛者”。为了生存下去，“非得找出背叛者并杀掉不可”。这是一场不存在“学级裁判”规则的自相残杀。杀或者被杀，在这极限状态的死亡游戏中，苗木诚等人被逼入绝境。希望杀死希望的绝望物语，就此拉开帷幕。